La UACJ está conformada por cuatro institutos y tres campus multidisciplinarios. En ellos se imparten los distintos programas de licenciatura y de posgrado que ofrecemos a la comunidad.

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Para la UACJ es muy importante brindar apoyo académico a sus alumnos, por tal motivo se cuenta con siguientes áreas:

• Dirección General de Extensión y Servicios Estudiantiles
• Subdirección de Innovación Educativa
• Dirección General de Servicios Académicos
• Dirección General de Vinculación e Interca​mbio