La visión de la Coordinación General de Investigación y Posgrado, es aquella que contribuye a visualizar a la UACJ como la instancia con presencia y compromiso social, a través de las funciones sustantivas en la generación del conocimiento. En el 2012, el posgrado y la investigación en la UACJ se integran sustantivamente para obtener el reconocimiento nacional e internacional por sus resultados:
A) En la calidad académica de sus plantas docentes;
B) En la competencia y aceptación de sus egresados en los ámbitos académicos y del trabajo;
C) En la pertinencia de sus planes de estudios;
D) En el impacto de sus procesos transferencia tecnológica, innovación, desarrollo de líneas de generación y aplicación del conocimiento orientadas a la formación de recursos humanos de lata calificación;
E) En la solución de problemas para la mejora de los ambientes socioeconómicos y físicos de la región
Estos resultados se sustentan en una normatividad actualizada y en políticas de mejora continua que alientan la productividad, consolidación de los cuerpos académicos, formación de redes, movilidad académica, atención integral a estudiantes y elevadas tasas de terminación y titulación; También se caracteriza por aprovechamiento optimo del profesorado de alto perfil y de la infraestructura académica de vanguardia, así como por la atracción de aspirantes de alto desempeño de los ámbitos regionales y nacionales.