Al ingresar un aspirante, se le asigna un Comité formado por tres tutores en función del área de conocimiento y línea de investigación correspondiente a su anteproyecto de investigación. El estudiante y el tutor principal preparan, para su aprobación por los otros tutores, un programa de actividades académicas a realizar a lo largo de los seis semestres de duración que demanda los estudios de Doctorado.

El programa no es de carácter presencial sin embargo, el Comité Tutoral podrá asignar a su alumno actividades académicas complementarias en relación con los requerimientos del proyecto a realizar o bien para enriquecer su dominio del campo sujeto a investigación.

Entre las actividades académicas complementarias podrán incluirse cursos, seminarios y talleres cuya calificación mínima aprobatoria se sujetará a lo señalado por el Reglamento General de Exámenes de la UNAM, así como la asistencia a reuniones, foros, coloquios y congresos nacionales e internacionales.