La primera etapa está orientada a transformar el anteproyecto de investigación en un protocolo de tesis a través de las sesiones de tutoría, el cual deberá defender exitosamente al finalizar el segundo semestre de estudios ante el Comité Tutor, además cubrirá las actividades académicas complementarias que sean acordadas con su tutor.

La segunda etapa, con una duración aproximada de dos semestres, está orientada al desarrollo de la investigación propuesta en su protocolo de tesis, dicho avance deberá ser presentado para la obtención de su candidatura al grado de doctor, y si es el caso, deberá cubrir las actividades académicas complementarias asignadas.

La tercera etapa, con una duración aproximada de dos semestres, el alumno lo dedicará íntegramente a la culminación de su trabajo de investigación y en su caso a cubrir las actividades académicas complementarias.

Durante el desarrollo de las tres etapas el alumno deberá obtener una evaluación semestral favorable por parte de su comité Tutor.